Фосфориты обнаруживаются в отложениях наиболее разного возраста, начиная с докембрия. К среднекембрийским породам относится крупное месторождение фосфоритов геосинклинального типа в Кара-Тау (Средняя Азия). В нижнем силуре складывались фосфориты Подолии, Прибалтики и востока Сибири, в нижнем карбоне — фосфориты Закавказья. В артинское время в Западном Приуралье возникли слабые залежи геосинклинальной формации. Геосинклинальные образования широко распространены в пермских отложениях США (Скалистые Горы).
Юрские, меловые и в малой степени палеогеновые отложения европейской части России заключают в себе горизонты желвакообразных и отчасти пластовых (Вольск) фосфоритов. Значительные месторождения фосфоритов знакомы в верхнемеловых и палеогеновых отложениях Северной Африки, которые относились ранее к геосинклинальным.
Самыми значительными эпохами фосфоритообразования являли собой кембрийский, пермский и третичный периоды.